法律分析：公司实际出资额大于注册资本是可以的，当实际出资额大于注册资本时可以通过以下方法处理：1、可以通过增资扩股变更工商登记的注册资本信息，重新划分出资份额比例;2、可以将超出注册资本的部分划为公司向股东借款，通过其他应付款核算。
法律依据：《中华人民共和国公司法》第一百七十 有限责任公司增加注册资本时，股东认缴新增资本的出资，依照本法设立有限责任公司缴纳出资的有关规定执行。股份有限公司为增加注册资本发行新股时，股东认购新股，依照本法设立股份有限公司缴纳股款的有关规定执行。